Stypendia Towarzystwa Samorządowego przyznawane są w celu wspierania młodzieży osiągającej wysokie wyniki w nauce, która dla swego rozwoju potrzebuje wsparcia. O stypendium mogą się ubiegać osoby wszystkich typów szkół średnich będące w trudnej sytuacji materialnej, pochodzące z rodzin dotkniętych problemami społecznymi, osiągające szczególnie wysokie wyniki w nauce lub wybitnie uzdolnione w wybranym kierunku.
Od roku szkolnego 2006/2007 Fundusz Stypendialny Towarzystwa Samorządowego objęty jest Programem Równe Szanse – Lokalne Programy Stypendialne realizowanym przez Fundację im. Stefana Batorego. Fundacja wspiera sieć organizacji pozarządowych, które prowadzą lokalne programy stypendialne dla uczniów szkół pochodzących z niezamożnych środowisk, szczególnie z mniejszych miejscowości. Otrzymana w ramach programu dotacja w całości przeznaczona zostaje na wypłatę stypendiów dla uczniów szkół średnich.
W imieniu Funduszu Stypendialnego Towarzystwa Samorządowego wyboru stypendystów dokonuje Komisja Stypendialna działająca w oparciu o Regulamin Komisji Stypendialnej Funduszu Stypendialnego, a zatwierdza Kapituła Funduszu Stypendialnego.
Komisja oceniając poszczególne wnioski kieruje się przede wszystkim następującymi kryteriami:
• wyniki w nauce
• sytuacja materialna ubiegającego się o stypendium
• szczególne osiągnięcia w nauce, sporcie itp., działalność w organizacjach pozarządowych,
wolontariat, aktywność społeczna itp.
Stypendia otrzymują osoby, które uzyskają największą liczbę punktów.